Када су у питању сценарији апликације, избор система за хлађење сервера зависи од специфичне конфигурације сервера и радног окружења. На пример, системи за течно хлађење могу бити погоднији за серверске полице-велике густине, где је простор ограничен, а топлота концентрисана; насупрот томе, системи за хлађење ваздуха су довољни за општа канцеларијска окружења или мале центре података. Поред тога, фактори као што су потрошња енергије, нивои буке и трошкови одржавања морају се узети у обзир када се бира решење за хлађење.
